（一）認(rèn)定
1．自我評(píng)價(jià)。企業(yè)應(yīng)對(duì)照《認(rèn)定辦法》第十條進(jìn)行自我評(píng)價(jià)。認(rèn)為符合條件的在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”（網(wǎng)址：www.innocom.gov.cn）進(jìn)行注冊(cè)登記。
2．注冊(cè)登記。企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”，按要求填寫《企業(yè)注冊(cè)登記表》（附1），并通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)上傳至認(rèn)定機(jī)構(gòu)。
認(rèn)定機(jī)構(gòu)應(yīng)及時(shí)完成企業(yè)身份確認(rèn)并將用戶名和密碼告知企業(yè)。
3．準(zhǔn)備并提交材料。企業(yè)根據(jù)獲得的用戶名和密碼進(jìn)入網(wǎng)上認(rèn)定管理系統(tǒng)，按要求將下列材料提交認(rèn)定機(jī)構(gòu)：
（1）《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請(qǐng)書》（附2）；
（2）企業(yè)營(yíng)業(yè)執(zhí)照副本、稅務(wù)登記證書（復(fù)印件）；
（3）經(jīng)具有資質(zhì)并符合本《工作指引》相關(guān)條件的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開發(fā)費(fèi)用（實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限）、近一個(gè)會(huì)計(jì)年度高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告；
（4）經(jīng)具有資質(zhì)的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的財(cái)務(wù)報(bào)表（含資產(chǎn)負(fù)債表、利潤(rùn)及利潤(rùn)分配表、現(xiàn)金流量表，實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限）；
（5）技術(shù)創(chuàng)新活動(dòng)證明材料，包括知識(shí)產(chǎn)權(quán)證書、獨(dú)占許可協(xié)議、生產(chǎn)批文，新產(chǎn)品或新技術(shù)證明（查新）材料、產(chǎn)品質(zhì)量檢驗(yàn)報(bào)告，省級(jí)（含計(jì)劃單列市）以上科技計(jì)劃立項(xiàng)證明，以及其他相關(guān)證明材料。
4．組織審查與認(rèn)定
（1）認(rèn)定機(jī)構(gòu)收到企業(yè)申請(qǐng)材料后，按技術(shù)領(lǐng)域從專家?guī)熘须S機(jī)抽取不少于5名相關(guān)專家，并將電子材料（隱去企業(yè)身份信息）通過網(wǎng)絡(luò)工作系統(tǒng)分發(fā)給所選專家。
（2）認(rèn)定機(jī)構(gòu)收到專家的評(píng)價(jià)意見和中介機(jī)構(gòu)的專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告后，對(duì)申請(qǐng)企業(yè)提出認(rèn)定意見，并確定高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定名單。
上述工作應(yīng)在收到企業(yè)申請(qǐng)材料后60個(gè)工作日內(nèi)完成。
5．公示及頒發(fā)證書
經(jīng)認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)，在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”上公示15個(gè)工作日。公示有異議的，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)對(duì)有關(guān)問題進(jìn)行查實(shí)處理，屬實(shí)的應(yīng)取消高新技術(shù)企業(yè)資格；公示無異議的，填寫高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定機(jī)構(gòu)審批備案匯總表，報(bào)領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室備案后，在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”上公告認(rèn)定結(jié)果，并由認(rèn)定機(jī)構(gòu)頒發(fā)“高新技術(shù)企業(yè)證書”（加蓋科技、財(cái)政、稅務(wù)部門公章）。具體認(rèn)定流程如下圖所示：
6.高新技術(shù)企業(yè)資格自頒發(fā)證書之日起生效，有效期為三年。
（二）復(fù)審
1．高新技術(shù)企業(yè)資格期滿前三個(gè)月內(nèi)企業(yè)應(yīng)提出復(fù)審申請(qǐng)（復(fù)審申請(qǐng)書同附2），不提出復(fù)審申請(qǐng)或復(fù)審不合格的，其高新技術(shù)企業(yè)資格到期自動(dòng)失效。
2．高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審須提交近三個(gè)會(huì)計(jì)年度開展研究開發(fā)等技術(shù)創(chuàng)新活動(dòng)的報(bào)告，經(jīng)具有資質(zhì)并符合本《工作指引》相關(guān)條件的中介機(jī)構(gòu)出具的近三個(gè)會(huì)計(jì)年度企業(yè)研究與開發(fā)費(fèi)用、近一個(gè)會(huì)計(jì)年度高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告。
復(fù)審時(shí)應(yīng)對(duì)照《認(rèn)定辦法》第十條進(jìn)行審查，重點(diǎn)審查第（四）款。對(duì)符合條件的企業(yè)，按照第十一條（四）款進(jìn)行公示與備案，并由認(rèn)定機(jī)構(gòu)重新頒發(fā)“高新技術(shù)企業(yè)證書”（加蓋科技、財(cái)政、稅務(wù)部門公章）。
通過復(fù)審的高新技術(shù)企業(yè)資格自頒發(fā)“高新技術(shù)企業(yè)證書”之日起有效期為三年。有效期滿后，企業(yè)再次提出認(rèn)定申請(qǐng)的，按初次申請(qǐng)辦理。
（三）申請(qǐng)享受稅收政策
1.認(rèn)定（復(fù)審）合格的高新技術(shù)企業(yè)，自認(rèn)定（復(fù)審）當(dāng)年起可依照《企業(yè)所得稅法》及《中華人民共和國(guó)企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》（以下稱《實(shí)施條例》）、《中華人民共和國(guó)稅收征收管理法》（以下稱《稅收征管法》）、《中華人民共和國(guó)稅收征收管理法實(shí)施細(xì)則》（以下稱《實(shí)施細(xì)則》）和《認(rèn)定辦法》等有關(guān)規(guī)定，申請(qǐng)享受稅收優(yōu)惠政策。
2.未取得高新技術(shù)企業(yè)資格或不符合《企業(yè)所得稅法》及其《實(shí)施條例》、《稅收征管法》及其《實(shí)施細(xì)則》，以及《認(rèn)定辦法》等有關(guān)規(guī)定條件的企業(yè)，不得享受稅收優(yōu)惠。
（四）復(fù)核
對(duì)高新技術(shù)企業(yè)資格及其相關(guān)稅收政策落實(shí)產(chǎn)生爭(zhēng)議的，凡屬于《認(rèn)定辦法》第十四條、第十五條情況的企業(yè)，按《認(rèn)定辦法》規(guī)定辦理；屬于對(duì)是否符合第十條（四）款產(chǎn)生爭(zhēng)議的，應(yīng)組織復(fù)核，即采用企業(yè)自認(rèn)定前三個(gè)會(huì)計(jì)年度（企業(yè)實(shí)際經(jīng)營(yíng)不滿三年的，按實(shí)際經(jīng)營(yíng)時(shí)間）至爭(zhēng)議發(fā)生之日的研究開發(fā)費(fèi)用總額與同期銷售收入總額之比是否符合《認(rèn)定辦法》第十條（四）款規(guī)定，判別企業(yè)是否應(yīng)繼續(xù)保留高新技術(shù)企業(yè)資格和享受稅收優(yōu)惠政策。
1．自我評(píng)價(jià)。企業(yè)應(yīng)對(duì)照《認(rèn)定辦法》第十條進(jìn)行自我評(píng)價(jià)。認(rèn)為符合條件的在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”（網(wǎng)址：www.innocom.gov.cn）進(jìn)行注冊(cè)登記。
2．注冊(cè)登記。企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”，按要求填寫《企業(yè)注冊(cè)登記表》（附1），并通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)上傳至認(rèn)定機(jī)構(gòu)。
認(rèn)定機(jī)構(gòu)應(yīng)及時(shí)完成企業(yè)身份確認(rèn)并將用戶名和密碼告知企業(yè)。
3．準(zhǔn)備并提交材料。企業(yè)根據(jù)獲得的用戶名和密碼進(jìn)入網(wǎng)上認(rèn)定管理系統(tǒng)，按要求將下列材料提交認(rèn)定機(jī)構(gòu)：
（1）《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請(qǐng)書》（附2）；
（2）企業(yè)營(yíng)業(yè)執(zhí)照副本、稅務(wù)登記證書（復(fù)印件）；
（3）經(jīng)具有資質(zhì)并符合本《工作指引》相關(guān)條件的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度研究開發(fā)費(fèi)用（實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限）、近一個(gè)會(huì)計(jì)年度高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告；
（4）經(jīng)具有資質(zhì)的中介機(jī)構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的財(cái)務(wù)報(bào)表（含資產(chǎn)負(fù)債表、利潤(rùn)及利潤(rùn)分配表、現(xiàn)金流量表，實(shí)際年限不足三年的按實(shí)際經(jīng)營(yíng)年限）；
（5）技術(shù)創(chuàng)新活動(dòng)證明材料，包括知識(shí)產(chǎn)權(quán)證書、獨(dú)占許可協(xié)議、生產(chǎn)批文，新產(chǎn)品或新技術(shù)證明（查新）材料、產(chǎn)品質(zhì)量檢驗(yàn)報(bào)告，省級(jí)（含計(jì)劃單列市）以上科技計(jì)劃立項(xiàng)證明，以及其他相關(guān)證明材料。
4．組織審查與認(rèn)定
（1）認(rèn)定機(jī)構(gòu)收到企業(yè)申請(qǐng)材料后，按技術(shù)領(lǐng)域從專家?guī)熘须S機(jī)抽取不少于5名相關(guān)專家，并將電子材料（隱去企業(yè)身份信息）通過網(wǎng)絡(luò)工作系統(tǒng)分發(fā)給所選專家。
（2）認(rèn)定機(jī)構(gòu)收到專家的評(píng)價(jià)意見和中介機(jī)構(gòu)的專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告后，對(duì)申請(qǐng)企業(yè)提出認(rèn)定意見，并確定高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定名單。
上述工作應(yīng)在收到企業(yè)申請(qǐng)材料后60個(gè)工作日內(nèi)完成。
5．公示及頒發(fā)證書
經(jīng)認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)，在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”上公示15個(gè)工作日。公示有異議的，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)對(duì)有關(guān)問題進(jìn)行查實(shí)處理，屬實(shí)的應(yīng)取消高新技術(shù)企業(yè)資格；公示無異議的，填寫高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定機(jī)構(gòu)審批備案匯總表，報(bào)領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室備案后，在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”上公告認(rèn)定結(jié)果，并由認(rèn)定機(jī)構(gòu)頒發(fā)“高新技術(shù)企業(yè)證書”（加蓋科技、財(cái)政、稅務(wù)部門公章）。具體認(rèn)定流程如下圖所示：
6.高新技術(shù)企業(yè)資格自頒發(fā)證書之日起生效，有效期為三年。
（二）復(fù)審
1．高新技術(shù)企業(yè)資格期滿前三個(gè)月內(nèi)企業(yè)應(yīng)提出復(fù)審申請(qǐng)（復(fù)審申請(qǐng)書同附2），不提出復(fù)審申請(qǐng)或復(fù)審不合格的，其高新技術(shù)企業(yè)資格到期自動(dòng)失效。
2．高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審須提交近三個(gè)會(huì)計(jì)年度開展研究開發(fā)等技術(shù)創(chuàng)新活動(dòng)的報(bào)告，經(jīng)具有資質(zhì)并符合本《工作指引》相關(guān)條件的中介機(jī)構(gòu)出具的近三個(gè)會(huì)計(jì)年度企業(yè)研究與開發(fā)費(fèi)用、近一個(gè)會(huì)計(jì)年度高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告。
復(fù)審時(shí)應(yīng)對(duì)照《認(rèn)定辦法》第十條進(jìn)行審查，重點(diǎn)審查第（四）款。對(duì)符合條件的企業(yè)，按照第十一條（四）款進(jìn)行公示與備案，并由認(rèn)定機(jī)構(gòu)重新頒發(fā)“高新技術(shù)企業(yè)證書”（加蓋科技、財(cái)政、稅務(wù)部門公章）。
通過復(fù)審的高新技術(shù)企業(yè)資格自頒發(fā)“高新技術(shù)企業(yè)證書”之日起有效期為三年。有效期滿后，企業(yè)再次提出認(rèn)定申請(qǐng)的，按初次申請(qǐng)辦理。
（三）申請(qǐng)享受稅收政策
1.認(rèn)定（復(fù)審）合格的高新技術(shù)企業(yè)，自認(rèn)定（復(fù)審）當(dāng)年起可依照《企業(yè)所得稅法》及《中華人民共和國(guó)企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》（以下稱《實(shí)施條例》）、《中華人民共和國(guó)稅收征收管理法》（以下稱《稅收征管法》）、《中華人民共和國(guó)稅收征收管理法實(shí)施細(xì)則》（以下稱《實(shí)施細(xì)則》）和《認(rèn)定辦法》等有關(guān)規(guī)定，申請(qǐng)享受稅收優(yōu)惠政策。
2.未取得高新技術(shù)企業(yè)資格或不符合《企業(yè)所得稅法》及其《實(shí)施條例》、《稅收征管法》及其《實(shí)施細(xì)則》，以及《認(rèn)定辦法》等有關(guān)規(guī)定條件的企業(yè)，不得享受稅收優(yōu)惠。
（四）復(fù)核
對(duì)高新技術(shù)企業(yè)資格及其相關(guān)稅收政策落實(shí)產(chǎn)生爭(zhēng)議的，凡屬于《認(rèn)定辦法》第十四條、第十五條情況的企業(yè)，按《認(rèn)定辦法》規(guī)定辦理；屬于對(duì)是否符合第十條（四）款產(chǎn)生爭(zhēng)議的，應(yīng)組織復(fù)核，即采用企業(yè)自認(rèn)定前三個(gè)會(huì)計(jì)年度（企業(yè)實(shí)際經(jīng)營(yíng)不滿三年的，按實(shí)際經(jīng)營(yíng)時(shí)間）至爭(zhēng)議發(fā)生之日的研究開發(fā)費(fèi)用總額與同期銷售收入總額之比是否符合《認(rèn)定辦法》第十條（四）款規(guī)定，判別企業(yè)是否應(yīng)繼續(xù)保留高新技術(shù)企業(yè)資格和享受稅收優(yōu)惠政策。
