一、國際階段
PCT國際專利申請的第一階段是國際階段。包括國際專利申請的受理、形式審查、國際檢索和國際公布等必經(jīng)程序以及可選擇的國際初步審查程序。
1、受理申請
PCT受理局將對受理的PCT申請的文件進行形式審查，審查合格后則將國際PCT申請文件分別送交世界知識產(chǎn)權(quán)組織國際局和國際檢索單位。
2、國際檢索
PCT專利申請?zhí)峤缓?，在?guī)定的時間內(nèi)，受理國的專利局作為國際檢索單位將對PCT專利申請進行檢索，并做出國際檢索報告。
其中，國際檢索PCT專利申請?zhí)峤缓螅谝?guī)定的時間內(nèi)，中國專利局作為國際檢索單位將對PCT專利申請進行檢索，并作出國際檢索報告。該檢索報告在規(guī)定的時間內(nèi)將盡快送交PCT專利申請人和世界知識產(chǎn)權(quán)組織國際局。
自國際申請日（或優(yōu)先日）起滿18個月后，國際局將公布PCT國際專利申請和國際檢索單位做出檢索報告，并將該申請連同檢索報告送交該PCT專利申請要求的“指定國”的專利局。
3、國際初步審查
《專利合作條約》規(guī)定，國際初步審查程序不是強制性的。參加條約的國家如果是受PCT第二章約束的，其申請人可以請求國際初步審查單位對其申請進行國際初步審查。
國際初步審查的目的是為了就該發(fā)明是否具有新穎性、創(chuàng)造性、和實用性提出初步的意見。該審查意見對各個“指定國”沒有任何約束力。但是，PCT規(guī)定的標準是當前國際上通用的標準，而且該審查意見是由為數(shù)不多的國際初步審查單位在國際檢索的基礎(chǔ)上做出的，所以該報告是比較可靠和可以信賴的。
在參加《專利合作條約》時，有些國家不受PCT第二章約束。申請人請求國際初步審查時，只能從受PCT第二章約束的指定國中選定一些使用國際初步審查結(jié)果的國家，這些國家被稱為“選定國”。
中國專利局作為國際初步審查單位對國際申請進行審查后，將提出國際初步審查報告送交世界知識產(chǎn)權(quán)組織國際局并由國際局轉(zhuǎn)交申請人，同時國際局還將國際初步審查報告送交該申請的“選定國”。
申請人可以依據(jù)中國專利局作出的國際檢索報告、國際初步審查結(jié)果，決定下一步的行動，即是否進入國家階段(向其他國家申請)。
二、國家階段
進入國家階段的程序不是自動發(fā)生的，必須由申請人來啟動。申請人必須在自優(yōu)先權(quán)日30個月（在某些國家可能是20個月）內(nèi)辦理進入指定國（或選定國）國家階段的手續(xù)：繳納國家費用，遞交翻譯成該國語言的國際申請的譯文。有些國家的國家法規(guī)定進入國家階段的期限晚于30個月（或20個月）。
進入國家階段的期限是必須遵守的，即使國際初步審查報告尚未得到。在國際階段中沒有在自優(yōu)先權(quán)日起十九個月內(nèi)要求國際初步審查的國際申請，其進入國家階段（指定局）的期限是自優(yōu)先權(quán)日起20個月；在自優(yōu)先權(quán)日起十九個月內(nèi)提出國際初步審查要求的國際申請。
進入國家階段后，需要根據(jù)各國規(guī)定遞交國際申請文件的譯本（該國的官方語言）和繳納規(guī)定的國家費用。然后由各國專利局按其專利法規(guī)規(guī)定對其進行審查，并決定是否授予專利權(quán)。
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